Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmx1Q8VBT0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmx1Q8VBT0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmx1Q8VBT0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms