Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPPL3Q8TCT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPPL3Q8TCT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPPL3Q8TCT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms