Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC197Q8NCU1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC197Q8NCU1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC197Q8NCU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms