Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC185Q8N715 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC185Q8N715 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms