Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sash3Q8K352 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sash3Q8K352 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sash3Q8K352 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sash3Q8K352 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sash3Q8K352 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms