Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfip2Q8K221 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfip2Q8K221 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms