Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp38Q8BW70 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp38Q8BW70 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms