Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gabra5Q8BHJ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra5Q8BHJ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms