Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH04

Pck2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck2Q8BH04 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pck2Q8BH04 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pck2Q8BH04 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pck2Q8BH04 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pck2Q8BH04 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pck2Q8BH04 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pck2Q8BH04 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pck2Q8BH04 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pck2Q8BH04 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms