Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctdspl2Q8BG15 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdspl2Q8BG15 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms