Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M10.5Q85ZW7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms