Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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Zbed4Q80WQ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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Zbed4Q80WQ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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Zbed4Q80WQ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Zbed4Q80WQ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Zbed4Q80WQ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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Zbed4Q80WQ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zbed4Q80WQ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zbed4Q80WQ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms