Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphp3Q7TNH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp3Q7TNH6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp3Q7TNH6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms