Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed3Q78IS1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed3Q78IS1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms