Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mindy1Q76LS9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy1Q76LS9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms