Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpopQ6ZWS8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SpopQ6ZWS8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 561.3 ms