Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NinlQ6ZQ12 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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NinlQ6ZQ12 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NinlQ6ZQ12 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NinlQ6ZQ12 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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