Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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