Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HjurpQ6PG16 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HjurpQ6PG16 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms