Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Best3Q6H1V1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Best3Q6H1V1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best3Q6H1V1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms