Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnna3Q65CL1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnna3Q65CL1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms