Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itga6Q61739 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms