Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pafah1b2Q61206 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pafah1b2Q61206 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms