Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms