Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctc1Q5SUQ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms