Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q499E6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C1orf109Q499E6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms