Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmub2Q3V209 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmub2Q3V209 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmub2Q3V209 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms