Protein–RNA interactions for Protein: Q3URD2

Rprml, Reprimo-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmlQ3URD2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RprmlQ3URD2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RprmlQ3URD2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms