Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnf166Q3U9F6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf166Q3U9F6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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