Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasip1Q3U0S6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasip1Q3U0S6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasip1Q3U0S6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasip1Q3U0S6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rasip1Q3U0S6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rasip1Q3U0S6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rasip1Q3U0S6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rasip1Q3U0S6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasip1Q3U0S6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasip1Q3U0S6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms