Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrn4clQ3TYX2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn4clQ3TYX2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms