Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdnep1Q3TP92 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdnep1Q3TP92 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms