Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Cpne9Q1RLL3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Cpne9Q1RLL3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Cpne9Q1RLL3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Cpne9Q1RLL3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne9Q1RLL3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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