Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB2Q08289 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNB2Q08289 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNB2Q08289 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms