Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cab39Q06138 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cab39Q06138 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms