Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg2Q03517 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg2Q03517 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms