Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb2Q00977 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb2Q00977 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms