Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabpb1Q00420 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb1Q00420 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms