Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cry1P97784 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cry1P97784 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cry1P97784 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cry1P97784 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cry1P97784 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cry1P97784 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cry1P97784 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms