Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx3P81067 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx3P81067 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx3P81067 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx3P81067 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx3P81067 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx3P81067 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx3P81067 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx3P81067 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx3P81067 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx3P81067 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Irx3P81067 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx3P81067 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms