Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ErfP70459 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErfP70459 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErfP70459 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErfP70459 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErfP70459 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErfP70459 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErfP70459 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErfP70459 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErfP70459 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ErfP70459 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ErfP70459 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ErfP70459 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ErfP70459 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErfP70459 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErfP70459 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErfP70459 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErfP70459 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ErfP70459 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErfP70459 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErfP70459 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErfP70459 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErfP70459 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErfP70459 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErfP70459 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErfP70459 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErfP70459 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErfP70459 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErfP70459 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms