Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msx3P70354 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msx3P70354 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx3P70354 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx3P70354 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx3P70354 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx3P70354 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx3P70354 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx3P70354 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms