Protein–RNA interactions for Protein: P63147

Ube2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2bP63147 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2bP63147 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2bP63147 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2bP63147 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms