Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabrb3P63080 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabrb3P63080 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms