Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ACLYP53396 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACLYP53396 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACLYP53396 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACLYP53396 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACLYP53396 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACLYP53396 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACLYP53396 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACLYP53396 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACLYP53396 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACLYP53396 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACLYP53396 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACLYP53396 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACLYP53396 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACLYP53396 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACLYP53396 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACLYP53396 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACLYP53396 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACLYP53396 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACLYP53396 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACLYP53396 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACLYP53396 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACLYP53396 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACLYP53396 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACLYP53396 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACLYP53396 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACLYP53396 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACLYP53396 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACLYP53396 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACLYP53396 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ACLYP53396 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACLYP53396 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACLYP53396 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACLYP53396 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACLYP53396 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACLYP53396 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACLYP53396 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACLYP53396 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ACLYP53396 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACLYP53396 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACLYP53396 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACLYP53396 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACLYP53396 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACLYP53396 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACLYP53396 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACLYP53396 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACLYP53396 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACLYP53396 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACLYP53396 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACLYP53396 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACLYP53396 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACLYP53396 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACLYP53396 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACLYP53396 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACLYP53396 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACLYP53396 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACLYP53396 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms