Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo1bP46735 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo1bP46735 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms