Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-5P42582 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-5P42582 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms