Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sar1aP36536 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sar1aP36536 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sar1aP36536 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sar1aP36536 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sar1aP36536 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sar1aP36536 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms