Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNB1P35222 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms