Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LoxP28301 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LoxP28301 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LoxP28301 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LoxP28301 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LoxP28301 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LoxP28301 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LoxP28301 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LoxP28301 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LoxP28301 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LoxP28301 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LoxP28301 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LoxP28301 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LoxP28301 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LoxP28301 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LoxP28301 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms